Preguntas a la Biblia - ¿Amar a los enemigos?

Otro de los conflictos entre los valores éticos del Antiguo Testamento vs. el Nuevo Testamento.

Mateo 5:43-45

⁴³ Oísteis que fue dicho: Amarás a tu prójimo, y aborrecerás a tu enemigo.
⁴⁴Pero yo os digo: Amad a vuestros enemigos, bendecid a los que os maldicen, haced bien a los que os aborrecen, y orad por los que os ultrajan y os persiguen;
⁴⁵ para que seáis hijos de vuestro Padre que está en los cielos, que hace salir su sol sobre malos y buenos, y que hace llover sobre justos e injustos.

Deuteronomio 20:16-18

¹⁶ Pero de las ciudades de estos pueblos que Jehová tu Dios te da por heredad, ninguna persona dejarás con vida,
¹⁷ sino que los destruirás completamente: al heteo, al amorreo, al cananeo, al ferezeo, al heveo y al jebuseo, como Jehová tu Dios te ha mandado;
¹⁸ para que no os enseñen a hacer según todas sus abominaciones que ellos han hecho para sus dioses, y pequéis contra Jehová vuestro Dios.

Las palabras de Jesús y la Ley de Moisés son profundamente diferentes. ¿Cómo puede un texto bíblico llamarnos a amar a nuestros enemigos y en otro ordenar a Israel a cometer genocidio contra grupos étnicos solo porque poseen una religión diferente?